Protein–RNA interactions for Protein: A8K8P3

SFI1, Protein SFI1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFI1A8K8P3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SFI1A8K8P3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SFI1A8K8P3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SFI1A8K8P3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SFI1A8K8P3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SFI1A8K8P3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SFI1A8K8P3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SFI1A8K8P3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SFI1A8K8P3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SFI1A8K8P3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SFI1A8K8P3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SFI1A8K8P3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SFI1A8K8P3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SFI1A8K8P3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SFI1A8K8P3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SFI1A8K8P3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SFI1A8K8P3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SFI1A8K8P3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SFI1A8K8P3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SFI1A8K8P3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SFI1A8K8P3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SFI1A8K8P3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SFI1A8K8P3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SFI1A8K8P3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SFI1A8K8P3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SFI1A8K8P3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SFI1A8K8P3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SFI1A8K8P3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SFI1A8K8P3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SFI1A8K8P3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SFI1A8K8P3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SFI1A8K8P3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SFI1A8K8P3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SFI1A8K8P3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SFI1A8K8P3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SFI1A8K8P3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SFI1A8K8P3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SFI1A8K8P3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SFI1A8K8P3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SFI1A8K8P3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SFI1A8K8P3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SFI1A8K8P3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SFI1A8K8P3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SFI1A8K8P3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SFI1A8K8P3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SFI1A8K8P3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SFI1A8K8P3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SFI1A8K8P3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SFI1A8K8P3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SFI1A8K8P3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SFI1A8K8P3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SFI1A8K8P3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SFI1A8K8P3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SFI1A8K8P3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SFI1A8K8P3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SFI1A8K8P3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SFI1A8K8P3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SFI1A8K8P3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SFI1A8K8P3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SFI1A8K8P3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SFI1A8K8P3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SFI1A8K8P3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SFI1A8K8P3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SFI1A8K8P3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SFI1A8K8P3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SFI1A8K8P3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SFI1A8K8P3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SFI1A8K8P3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SFI1A8K8P3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SFI1A8K8P3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SFI1A8K8P3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SFI1A8K8P3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
SFI1A8K8P3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SFI1A8K8P3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SFI1A8K8P3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SFI1A8K8P3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SFI1A8K8P3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SFI1A8K8P3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SFI1A8K8P3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SFI1A8K8P3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SFI1A8K8P3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SFI1A8K8P3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SFI1A8K8P3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SFI1A8K8P3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SFI1A8K8P3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SFI1A8K8P3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SFI1A8K8P3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SFI1A8K8P3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SFI1A8K8P3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SFI1A8K8P3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SFI1A8K8P3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SFI1A8K8P3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SFI1A8K8P3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SFI1A8K8P3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SFI1A8K8P3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SFI1A8K8P3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SFI1A8K8P3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SFI1A8K8P3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SFI1A8K8P3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SFI1A8K8P3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms