Protein–RNA interactions for Protein: A6NLU5

VSTM2B, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2BA6NLU5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VSTM2BA6NLU5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VSTM2BA6NLU5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VSTM2BA6NLU5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VSTM2BA6NLU5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VSTM2BA6NLU5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VSTM2BA6NLU5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VSTM2BA6NLU5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VSTM2BA6NLU5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VSTM2BA6NLU5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VSTM2BA6NLU5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VSTM2BA6NLU5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VSTM2BA6NLU5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VSTM2BA6NLU5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VSTM2BA6NLU5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VSTM2BA6NLU5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VSTM2BA6NLU5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VSTM2BA6NLU5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VSTM2BA6NLU5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VSTM2BA6NLU5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VSTM2BA6NLU5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VSTM2BA6NLU5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VSTM2BA6NLU5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VSTM2BA6NLU5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VSTM2BA6NLU5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VSTM2BA6NLU5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VSTM2BA6NLU5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VSTM2BA6NLU5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VSTM2BA6NLU5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VSTM2BA6NLU5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VSTM2BA6NLU5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VSTM2BA6NLU5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VSTM2BA6NLU5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VSTM2BA6NLU5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VSTM2BA6NLU5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VSTM2BA6NLU5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VSTM2BA6NLU5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VSTM2BA6NLU5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VSTM2BA6NLU5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VSTM2BA6NLU5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VSTM2BA6NLU5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VSTM2BA6NLU5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VSTM2BA6NLU5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VSTM2BA6NLU5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VSTM2BA6NLU5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VSTM2BA6NLU5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VSTM2BA6NLU5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VSTM2BA6NLU5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VSTM2BA6NLU5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VSTM2BA6NLU5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VSTM2BA6NLU5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VSTM2BA6NLU5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VSTM2BA6NLU5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VSTM2BA6NLU5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSTM2BA6NLU5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSTM2BA6NLU5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSTM2BA6NLU5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSTM2BA6NLU5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSTM2BA6NLU5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
VSTM2BA6NLU5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VSTM2BA6NLU5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VSTM2BA6NLU5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VSTM2BA6NLU5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VSTM2BA6NLU5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VSTM2BA6NLU5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VSTM2BA6NLU5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VSTM2BA6NLU5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VSTM2BA6NLU5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VSTM2BA6NLU5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VSTM2BA6NLU5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VSTM2BA6NLU5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VSTM2BA6NLU5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VSTM2BA6NLU5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VSTM2BA6NLU5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSTM2BA6NLU5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSTM2BA6NLU5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSTM2BA6NLU5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSTM2BA6NLU5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VSTM2BA6NLU5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSTM2BA6NLU5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VSTM2BA6NLU5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VSTM2BA6NLU5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VSTM2BA6NLU5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VSTM2BA6NLU5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VSTM2BA6NLU5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VSTM2BA6NLU5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VSTM2BA6NLU5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VSTM2BA6NLU5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VSTM2BA6NLU5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VSTM2BA6NLU5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VSTM2BA6NLU5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VSTM2BA6NLU5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VSTM2BA6NLU5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VSTM2BA6NLU5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VSTM2BA6NLU5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VSTM2BA6NLU5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
VSTM2BA6NLU5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VSTM2BA6NLU5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VSTM2BA6NLU5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VSTM2BA6NLU5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms