Protein–RNA interactions for Protein: A6NK53

ZNF233, Zinc finger protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF233A6NK53 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF233A6NK53 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF233A6NK53 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF233A6NK53 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF233A6NK53 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF233A6NK53 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF233A6NK53 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF233A6NK53 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF233A6NK53 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF233A6NK53 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF233A6NK53 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF233A6NK53 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF233A6NK53 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF233A6NK53 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF233A6NK53 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF233A6NK53 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF233A6NK53 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF233A6NK53 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF233A6NK53 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF233A6NK53 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF233A6NK53 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF233A6NK53 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF233A6NK53 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF233A6NK53 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF233A6NK53 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF233A6NK53 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF233A6NK53 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF233A6NK53 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF233A6NK53 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF233A6NK53 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF233A6NK53 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF233A6NK53 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF233A6NK53 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF233A6NK53 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF233A6NK53 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF233A6NK53 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF233A6NK53 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF233A6NK53 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF233A6NK53 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF233A6NK53 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF233A6NK53 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF233A6NK53 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF233A6NK53 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF233A6NK53 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF233A6NK53 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF233A6NK53 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF233A6NK53 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF233A6NK53 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF233A6NK53 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF233A6NK53 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF233A6NK53 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF233A6NK53 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF233A6NK53 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF233A6NK53 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF233A6NK53 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF233A6NK53 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF233A6NK53 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF233A6NK53 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF233A6NK53 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF233A6NK53 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF233A6NK53 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF233A6NK53 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF233A6NK53 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF233A6NK53 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF233A6NK53 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF233A6NK53 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF233A6NK53 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF233A6NK53 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ZNF233A6NK53 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF233A6NK53 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF233A6NK53 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF233A6NK53 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF233A6NK53 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF233A6NK53 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF233A6NK53 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF233A6NK53 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF233A6NK53 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF233A6NK53 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF233A6NK53 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF233A6NK53 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF233A6NK53 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF233A6NK53 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF233A6NK53 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF233A6NK53 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF233A6NK53 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF233A6NK53 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF233A6NK53 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF233A6NK53 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF233A6NK53 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF233A6NK53 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF233A6NK53 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF233A6NK53 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF233A6NK53 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF233A6NK53 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF233A6NK53 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF233A6NK53 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF233A6NK53 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF233A6NK53 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF233A6NK53 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF233A6NK53 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms