Protein–RNA interactions for Protein: A6NIK2

LRRC10B, Leucine-rich repeat-containing protein 10B, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC10BA6NIK2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC10BA6NIK2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC10BA6NIK2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC10BA6NIK2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC10BA6NIK2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC10BA6NIK2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC10BA6NIK2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC10BA6NIK2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC10BA6NIK2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC10BA6NIK2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC10BA6NIK2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC10BA6NIK2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC10BA6NIK2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC10BA6NIK2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC10BA6NIK2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC10BA6NIK2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC10BA6NIK2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC10BA6NIK2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC10BA6NIK2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC10BA6NIK2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC10BA6NIK2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC10BA6NIK2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LRRC10BA6NIK2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC10BA6NIK2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC10BA6NIK2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC10BA6NIK2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC10BA6NIK2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC10BA6NIK2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC10BA6NIK2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC10BA6NIK2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC10BA6NIK2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC10BA6NIK2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC10BA6NIK2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC10BA6NIK2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC10BA6NIK2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC10BA6NIK2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC10BA6NIK2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC10BA6NIK2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC10BA6NIK2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC10BA6NIK2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC10BA6NIK2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC10BA6NIK2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC10BA6NIK2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC10BA6NIK2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC10BA6NIK2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC10BA6NIK2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC10BA6NIK2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC10BA6NIK2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC10BA6NIK2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC10BA6NIK2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC10BA6NIK2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LRRC10BA6NIK2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
LRRC10BA6NIK2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LRRC10BA6NIK2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC10BA6NIK2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC10BA6NIK2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC10BA6NIK2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC10BA6NIK2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC10BA6NIK2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC10BA6NIK2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC10BA6NIK2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC10BA6NIK2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC10BA6NIK2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC10BA6NIK2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC10BA6NIK2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC10BA6NIK2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC10BA6NIK2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC10BA6NIK2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC10BA6NIK2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC10BA6NIK2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC10BA6NIK2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC10BA6NIK2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC10BA6NIK2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC10BA6NIK2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC10BA6NIK2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC10BA6NIK2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC10BA6NIK2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC10BA6NIK2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC10BA6NIK2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC10BA6NIK2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC10BA6NIK2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC10BA6NIK2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC10BA6NIK2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC10BA6NIK2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC10BA6NIK2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC10BA6NIK2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC10BA6NIK2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC10BA6NIK2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC10BA6NIK2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC10BA6NIK2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC10BA6NIK2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC10BA6NIK2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC10BA6NIK2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC10BA6NIK2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC10BA6NIK2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC10BA6NIK2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC10BA6NIK2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC10BA6NIK2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC10BA6NIK2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC10BA6NIK2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms