Protein–RNA interactions for Protein: A6NHC0

CAPN8, Calpain-8, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN8A6NHC0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN8A6NHC0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN8A6NHC0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN8A6NHC0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN8A6NHC0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN8A6NHC0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN8A6NHC0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN8A6NHC0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN8A6NHC0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN8A6NHC0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN8A6NHC0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN8A6NHC0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN8A6NHC0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN8A6NHC0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN8A6NHC0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN8A6NHC0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN8A6NHC0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN8A6NHC0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN8A6NHC0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN8A6NHC0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN8A6NHC0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN8A6NHC0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN8A6NHC0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN8A6NHC0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN8A6NHC0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN8A6NHC0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN8A6NHC0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN8A6NHC0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN8A6NHC0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN8A6NHC0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN8A6NHC0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN8A6NHC0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN8A6NHC0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN8A6NHC0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN8A6NHC0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN8A6NHC0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAPN8A6NHC0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAPN8A6NHC0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAPN8A6NHC0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAPN8A6NHC0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAPN8A6NHC0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CAPN8A6NHC0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CAPN8A6NHC0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CAPN8A6NHC0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CAPN8A6NHC0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN8A6NHC0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN8A6NHC0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN8A6NHC0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN8A6NHC0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN8A6NHC0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN8A6NHC0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN8A6NHC0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN8A6NHC0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN8A6NHC0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN8A6NHC0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN8A6NHC0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN8A6NHC0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN8A6NHC0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN8A6NHC0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN8A6NHC0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN8A6NHC0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN8A6NHC0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN8A6NHC0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN8A6NHC0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN8A6NHC0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN8A6NHC0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN8A6NHC0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN8A6NHC0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN8A6NHC0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN8A6NHC0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN8A6NHC0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN8A6NHC0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN8A6NHC0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN8A6NHC0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN8A6NHC0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN8A6NHC0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN8A6NHC0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN8A6NHC0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN8A6NHC0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CAPN8A6NHC0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CAPN8A6NHC0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CAPN8A6NHC0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN8A6NHC0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN8A6NHC0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN8A6NHC0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN8A6NHC0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN8A6NHC0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN8A6NHC0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN8A6NHC0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN8A6NHC0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN8A6NHC0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN8A6NHC0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN8A6NHC0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN8A6NHC0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN8A6NHC0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN8A6NHC0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN8A6NHC0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN8A6NHC0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN8A6NHC0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN8A6NHC0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.2 ms