Protein–RNA interactions for Protein: A0PJX0

CIB4, Calcium and integrin-binding family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIB4A0PJX0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CIB4A0PJX0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CIB4A0PJX0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CIB4A0PJX0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CIB4A0PJX0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CIB4A0PJX0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CIB4A0PJX0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CIB4A0PJX0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CIB4A0PJX0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CIB4A0PJX0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CIB4A0PJX0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIB4A0PJX0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIB4A0PJX0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIB4A0PJX0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIB4A0PJX0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIB4A0PJX0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIB4A0PJX0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIB4A0PJX0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIB4A0PJX0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIB4A0PJX0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIB4A0PJX0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIB4A0PJX0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIB4A0PJX0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIB4A0PJX0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIB4A0PJX0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIB4A0PJX0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIB4A0PJX0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIB4A0PJX0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIB4A0PJX0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIB4A0PJX0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIB4A0PJX0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIB4A0PJX0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIB4A0PJX0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIB4A0PJX0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIB4A0PJX0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIB4A0PJX0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIB4A0PJX0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIB4A0PJX0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIB4A0PJX0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIB4A0PJX0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIB4A0PJX0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIB4A0PJX0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIB4A0PJX0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIB4A0PJX0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIB4A0PJX0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIB4A0PJX0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CIB4A0PJX0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CIB4A0PJX0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CIB4A0PJX0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIB4A0PJX0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIB4A0PJX0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIB4A0PJX0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIB4A0PJX0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIB4A0PJX0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIB4A0PJX0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIB4A0PJX0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIB4A0PJX0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIB4A0PJX0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIB4A0PJX0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIB4A0PJX0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIB4A0PJX0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIB4A0PJX0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIB4A0PJX0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIB4A0PJX0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CIB4A0PJX0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CIB4A0PJX0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CIB4A0PJX0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CIB4A0PJX0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CIB4A0PJX0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CIB4A0PJX0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CIB4A0PJX0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CIB4A0PJX0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CIB4A0PJX0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CIB4A0PJX0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CIB4A0PJX0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CIB4A0PJX0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CIB4A0PJX0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CIB4A0PJX0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CIB4A0PJX0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CIB4A0PJX0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CIB4A0PJX0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CIB4A0PJX0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIB4A0PJX0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIB4A0PJX0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIB4A0PJX0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIB4A0PJX0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIB4A0PJX0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIB4A0PJX0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIB4A0PJX0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIB4A0PJX0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIB4A0PJX0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIB4A0PJX0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIB4A0PJX0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CIB4A0PJX0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CIB4A0PJX0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CIB4A0PJX0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CIB4A0PJX0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CIB4A0PJX0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CIB4A0PJX0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CIB4A0PJX0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms