Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Z2

LINC01558, Uncharacterized protein encoded by LINC01558, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01558Q9Y6Z2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms