Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W9

SNX11, Sorting nexin-11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11Q9Y5W9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX11Q9Y5W9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms