Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD2APQ9Y5K6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms