Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

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Length 3,996 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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HECTD4Q9Y4D8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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HECTD4Q9Y4D8 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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HECTD4Q9Y4D8 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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HECTD4Q9Y4D8 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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