Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms