Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms