Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF330Q9Y3S2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF330Q9Y3S2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms