Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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SH3BP1Q9Y3L3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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SH3BP1Q9Y3L3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
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SH3BP1Q9Y3L3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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SH3BP1Q9Y3L3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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SH3BP1Q9Y3L3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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SH3BP1Q9Y3L3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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SH3BP1Q9Y3L3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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SH3BP1Q9Y3L3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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