Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC27.51■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms