Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y234

LIPT1, Lipoyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT1Q9Y234 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LIPT1Q9Y234 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms