Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5BQ9UGL1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms