Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLIP2Q9UDT6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms