Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms