Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK3Q9UBP4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms