Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM8

MGAT4C, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase C, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT4CQ9UBM8 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MGAT4CQ9UBM8 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms