Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC88CQ9P219 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC88CQ9P219 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms