Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNRD1Q9P1U0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms