Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NKIRAS1Q9NYS0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKIRAS1Q9NYS0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms