Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXC10Q9NYD6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXC10Q9NYD6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXC10Q9NYD6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXC10Q9NYD6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXC10Q9NYD6 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXC10Q9NYD6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXC10Q9NYD6 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC10Q9NYD6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC10Q9NYD6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC10Q9NYD6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC10Q9NYD6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC10Q9NYD6 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC10Q9NYD6 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC10Q9NYD6 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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HOXC10Q9NYD6 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC10Q9NYD6 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC10Q9NYD6 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC10Q9NYD6 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC10Q9NYD6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC10Q9NYD6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC10Q9NYD6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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HOXC10Q9NYD6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC10Q9NYD6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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HOXC10Q9NYD6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC10Q9NYD6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
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HOXC10Q9NYD6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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HOXC10Q9NYD6 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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HOXC10Q9NYD6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC10Q9NYD6 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC10Q9NYD6 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC10Q9NYD6 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC10Q9NYD6 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC10Q9NYD6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC10Q9NYD6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC10Q9NYD6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC10Q9NYD6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC10Q9NYD6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC10Q9NYD6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC10Q9NYD6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXC10Q9NYD6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXC10Q9NYD6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXC10Q9NYD6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXC10Q9NYD6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXC10Q9NYD6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXC10Q9NYD6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXC10Q9NYD6 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXC10Q9NYD6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXC10Q9NYD6 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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