Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX18

SDHAF2, Succinate dehydrogenase assembly factor 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF2Q9NX18 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms