Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW68

BSDC1, BSD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSDC1Q9NW68 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms