Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 CT45A11P-201ENST00000448043 1134 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 AC055748.1-201ENST00000489836 959 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms