Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms