Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV6

PRDM10, PR domain zinc finger protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM10Q9NQV6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms