Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms