Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms