Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKRIP1Q9H875 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms