Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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