Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCSER1Q9C0I3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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