Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP44Q9C0F1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms