Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms