Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms