Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms