Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms