Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTA3Q9BTC8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms