Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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