Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms