Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms