Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms