Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SIN3AQ96ST3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIN3AQ96ST3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms