Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAMD8Q96LT4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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