Protein–RNA interactions for Protein: Q96JK4

HHIPL1, HHIP-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPL1Q96JK4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HHIPL1Q96JK4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HHIPL1Q96JK4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HHIPL1Q96JK4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HHIPL1Q96JK4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HHIPL1Q96JK4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HHIPL1Q96JK4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HHIPL1Q96JK4 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HHIPL1Q96JK4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HHIPL1Q96JK4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HHIPL1Q96JK4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HHIPL1Q96JK4 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HHIPL1Q96JK4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HHIPL1Q96JK4 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HHIPL1Q96JK4 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HHIPL1Q96JK4 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HHIPL1Q96JK4 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HHIPL1Q96JK4 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HHIPL1Q96JK4 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HHIPL1Q96JK4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HHIPL1Q96JK4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HHIPL1Q96JK4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HHIPL1Q96JK4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HHIPL1Q96JK4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HHIPL1Q96JK4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HHIPL1Q96JK4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HHIPL1Q96JK4 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HHIPL1Q96JK4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HHIPL1Q96JK4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HHIPL1Q96JK4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HHIPL1Q96JK4 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HHIPL1Q96JK4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HHIPL1Q96JK4 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HHIPL1Q96JK4 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HHIPL1Q96JK4 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HHIPL1Q96JK4 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HHIPL1Q96JK4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HHIPL1Q96JK4 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HHIPL1Q96JK4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HHIPL1Q96JK4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HHIPL1Q96JK4 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HHIPL1Q96JK4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HHIPL1Q96JK4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HHIPL1Q96JK4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HHIPL1Q96JK4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HHIPL1Q96JK4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HHIPL1Q96JK4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HHIPL1Q96JK4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HHIPL1Q96JK4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HHIPL1Q96JK4 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HHIPL1Q96JK4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HHIPL1Q96JK4 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HHIPL1Q96JK4 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HHIPL1Q96JK4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HHIPL1Q96JK4 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HHIPL1Q96JK4 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HHIPL1Q96JK4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HHIPL1Q96JK4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HHIPL1Q96JK4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HHIPL1Q96JK4 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HHIPL1Q96JK4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HHIPL1Q96JK4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HHIPL1Q96JK4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HHIPL1Q96JK4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HHIPL1Q96JK4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HHIPL1Q96JK4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HHIPL1Q96JK4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHIPL1Q96JK4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HHIPL1Q96JK4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHIPL1Q96JK4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHIPL1Q96JK4 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHIPL1Q96JK4 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHIPL1Q96JK4 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHIPL1Q96JK4 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHIPL1Q96JK4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHIPL1Q96JK4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHIPL1Q96JK4 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HHIPL1Q96JK4 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHIPL1Q96JK4 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHIPL1Q96JK4 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHIPL1Q96JK4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHIPL1Q96JK4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHIPL1Q96JK4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHIPL1Q96JK4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHIPL1Q96JK4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHIPL1Q96JK4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHIPL1Q96JK4 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHIPL1Q96JK4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHIPL1Q96JK4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HHIPL1Q96JK4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HHIPL1Q96JK4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HHIPL1Q96JK4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HHIPL1Q96JK4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HHIPL1Q96JK4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HHIPL1Q96JK4 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HHIPL1Q96JK4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HHIPL1Q96JK4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HHIPL1Q96JK4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HHIPL1Q96JK4 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HHIPL1Q96JK4 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms