Protein–RNA interactions for Protein: Q96HW7

INTS4, Integrator complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS4Q96HW7 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
INTS4Q96HW7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms