Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms